ב-1901 הקים בדרום רוסיה אגודה ציונית סוציאליסטית שאחד מדגליה האידיאולוגיים היה הגנה עצמית ליהודים. בשנת 1903 בפרוץ משבר אוגנדה התקרב בורוכוב לתנועה הציונית ולאוסישקין שעמד בראש הלוחמים בהרצל בפרט. עבד כמטיף ציוני אצל אוסישקין והצטרף לתנועה שהקים "ציוני ציון" ששללו כל פיתרון ציוני מחוץ לארץ ישראל. בפרוץ מהפכת 1905 עבר שוב תפנית אידיאולוגית, ושוב ראה בצרוף ציונות וסוציאליזם את הפתרון הנכון לעם היהודי.