דרייפוס חזר לצבא, הועלה לדרגת לוטנט קולונל, והוענק לו אות "לגיון הכבוד".
נפטר בשנת 1935.
פרשה זו זיעזעה את צרפת והביאה לפני השטח את הדיון של האנטישמיות. כתוצאה מפרשה זו הוצעה הצעת החוק להפרדת הדת מן המדינה.
משפט דרייפוס השפיע על התעוררות הכרתם הלאומית של הרצל ונורדאו. לאחר יציאת פסק הדין, כתב הרצל את מדינת היהודים שהוותה את תחילת דרכו הציונית להקמת בית לאומי ליהודים.