במהלך שנותיה האחרונות המשיכה פרויד את דרכו של אביה. היא דגלה בפסיכואנליזה הפרוידיאנית שייסד זיגמונד פרויד, וכתבה מספר מאמרים וספרים בנושא, אולם עניינה העיקרי של פרויד היה לעולם עולמם הנפשי של הילדים.
פרויד קנתה לה שם בעולם הפסיכואנליטיקה, והוזמנה להרצות באוניברסיטאות יוקרתיות ברחבי העולם.
ב- 1980 הוענק לה תואר כבוד מאוניברסיטת הרוורד.
אנה פרויד נפטרה בביתה בלונדון ב- 9 באוקטובר 1982.
את הביוגרפיה שלה סיכמה פעם כך: "היא בילתה את חייה עם ילדים", אולם חרף אהבתה הגדולה לצעירים, מעולם לא היו לה ילדים משלה, ואנה פרויד נותרה רווקה כל ימיה.